Przegląd aktualnie dostępnych technologii sekwencjonowania kwasów nukleinowych

• fot. iStock

Sekwencjonowanie trzeciej generacji

Trzecia generacja sekwencjonowania umożliwia sekwencjonowanie pojedynczych cząsteczek (SMS), sekwencjonowanie w czasie rzeczywistym i sekwencjonowanie długich odczytów. Długość odczytu z natywnego DNA może przekraczać 10 kilo par zasad. Sekwencjonowanie pojedynczej cząsteczki neguje wymóg amplifikacji DNA, wspólny dla dwóch wcześniejszych generacji. Początkowo technologie sekwencjonowania długich odczytów borykały się z problemem niskiej jakości odczytów, jednak ostatnie modyfikacje i ulepszenia znacząco zwiększyły dokładność sekwencjonowania. Sekwencjonowanie trzeciej generacji znacząco ułatwiło analizę genomów roślinnych, które częstokroć są poliploidalne i zawierają kilka homeologicznych genomów oraz znaczny udział sekwencji repetytywnych.

Oxford Nanopore Technology (ONT)

Firma Oxford Nanopore Technologies (ONT) w 2007 r. opatentowała technologię sekwencjonowania nanoporowego, a w 2010 r. rozpoczęła prace nad wewnętrznym sekwencjonowaniem nici DNA ...