Przegląd aktualnie dostępnych technologii sekwencjonowania kwasów nukleinowych

• fot. iStock

Sekwencjonowanie DNA-Seq wykorzystuje się do sekwencjonowania genomów, eksomów, epigenomu, targetowego resekwencjonowania fragmentów genomów, genotypowania. RNA-Seq można podzielić na: sekwencjonowanie całego transkryptomu, mRNA (mRNA-Seq) i małych RNA (smRNA-Seq). Jest wykorzystywane w badaniach z zakresu genomiki funkcjonalnej, różnicowej analiz ekspresji genów, alternatywnego splicingu i analizy wariantów.

W ciągu prawie 70 lat od odkrycia struktury DNA przez Jamesa Watsona i Francisa Cricka [1] rozwinął się szereg różnych technologii pozwalających na poznanie sekwencji nukleotydów w cząsteczkach DNA. Postęp technologiczny, jaki dokonał się na przestrzeni ostatnich 15 lat, sprawił, że sekwencjonowanie stało się rutynową i ogólnodostępną analizą w biologii molekularnej. W 1953 roku Sanger i Thompson opublikowali sekwencję pierwszej cząsteczki biologicznej [2]. Była to sekwencja dwóch łańcuchów białka insuliny. Dalsze prace pozwoliły na zsekwencjonowanie pierwszej cząsteczki RNA. W 1965 r. Holley i wsp. poznali sekwencję 76 nukleotydów tRNA alaniny z Saccharomyces cerevisiae [3]. Dopiero w 1972 r. w laboratorium W...