Badacz GUMed współautorem publikacji o nowych gatunkach bakterii

Naukowcy, a wśród nich dr hab. Ravi Kant z GUMed, znaleźli 1 334 nowe gatunki bakterii w próbkach ścieków z pięciu europejskich miast. O ich odkryciu można przeczytać w „Nature Communications”.

Dr hab. Ravi Kant z Zakładu Parazytologii Tropikalnej Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego jest współautorem publikacji pt. „Time-series sewage metagenomics distinguishes seasonal, human-derived and environmental microbial communities potentially allowing source-attributed surveillance”. Artykuł ukazał się 30 sierpnia w czasopiśmie „Nature Communications”.

W pracy pod kierownictwem dr. Patricka Munka z Technical University of Denmark naukowcy analizowali próbki ścieków z pięciu europejskich miast, w wyniku czego zidentyfikowano 1 334 nowe gatunki bakterii. Dzięki analizom szeregów czasowych badanie ujawniło wzorce zastępowania taksonów bakteryjnych, trendy sezonowe i taksony związane z człowiekiem.

Badacz GUMed w projekcie kierował rozwojem potoku bioinformatycznego zaprojektowanego specjalnie do analizy danych sekwencjonowania nowej generacji (NGS), ze szczególnym uwzględnieniem metagenomiki wirusów i bakterii. Ten innowacyjny potok odegrał kluczową rolę w analizie złożonych danych dotyczących ścieków podłużnych, przyczyniając się do pomyślnych wyników badania.

– Ponadto dr hab. Kant dołączył niedawno do rad redakcyjnych kilku prestiżowych czasopism, w tym „Viruses” (MDPI), „Frontiers in Microbiology” i „Frontiers in Tuberculosis”. Jego doświadczenie i wiedza w dziedzinie bioinformatyki i metagenomiki wciąż wywierają znaczący wpływ zarówno na bliższą społeczność akademicką, jak i na szerszy świat naukowy. Zainteresowania naukowe dr. hab. Kanta obejmują poszukiwanie nowych i powracających patogenów oraz badania nad zmiennością i ewolucją wirusów. Jego prace były dotychczas publikowane w znaczących czasopismach, takich jak „Nature” (publikacja pt. „Ancestral allele of DNA polymerase gamma modifies antiviral tolerance”) oraz „Plos Pathogenes” (publikacja pt. „The assembly of neutrophil inflammasomes during COVID-19 is mediated by type I interferons”) – podaje Gdański Uniwersytet Medyczny.

Źródło: Gdański Uniwersytet Medyczny

Czytaj także: O nowych mechanizmach regulujących cykl komórkowy